北京友谊医院平谷医院消化内科是北京市临床重点专科，承担着医疗、教学、科研、内镜培训等任务。消化内科设有病房、门诊、内镜中心，目前已经开展的亚专科有便秘、幽门螺杆菌、超声内镜、消化道肿瘤专病等门诊。对急性消化道大出血、急性消化道异物、急性胆源性胰腺炎、消化道肿瘤筛查、各种原因的肝硬化、急性腹膜炎和肝性脑病等疾病的诊疗有丰富的经验。为了保证急危重症患者的救治，开通了消化道出血、消化道异物、ERCP绿色通道。内镜中心配备先进的内镜设备，可以开展胃肠镜、十二指肠镜、放大内镜、经鼻胃镜、超声内镜、胶囊内镜、经皮胆道镜等检查，以及各种内镜下治疗，包括内镜下止血、内镜下粘膜切除术（EMR）、内镜粘膜下剥离术（ESD）、内镜逆行胰胆管造影术（ERCP）、内镜辅助下经皮胃造瘘（PEG）、消化道支架放置、食道静脉曲张套扎术、胃石碎石、消化内镜隧道技术、内镜逆行阑尾炎治疗术（ERAT）、超声内镜穿刺技术等。
2009年开始借助“模拟医院”的优势，举办消化内镜治疗技术培训班50余期，目前已经培训了来自全国各地包括台湾地区的医生1000余名，被北京医学会授予“首都消化内镜特色培训基地”。
消化内科现承担首都医科大学本专科生、甘肃医学院教学工作。现消化内科有4个国家级的基地，1个北京市基地，国家消化系统疾病临床医学研究中心平谷医院基地、全国基层超声内镜推广培训基地、全国老年消化道出血防控联盟等。
依托“区办市管 两院一科”的平台，成立了“北京友谊医院消化专家工作站”，北京友谊医院张澍田院长为工作站首席专家。在区委组织部的大力支持下成立“消化内镜技术高层次人才工作室”，并以此为契机培养了一支高水平的消化内镜人才团队，使平谷百姓在家门口就能够享受国内一流水平的内镜诊疗。
